Il body building classico come lo conoscono tutti è la ricerca continua (ed a volte estrema) dell'aumento dei volumi delle masse muscolari tramite i classici e noiosissimi esercizi di isolamento con macchine, manubri e bilancieri.
Nel CrossFit l'aumento della massa muscolare che si raggiunge è un effetto collaterale positivo, è molto più armonico e meno esasperato del body building e soparttutto non fine a sé stesso, ma è sempre funzionale ad un aumento generale della forza e della potenza dell'atleta.

Il CrossFit è un programma che prevede l'aumento della forza e della capacità di lavoro, puntando sull'alta intensità. Gli esercizi del CrossFit sono molteplici, prendono in prestito movimenti anche della ginnastica ma anche corsa, salto della corda, arrampicata, sollevamento pesi e spostamento di attrezzi pesanti. Nel CrossFit c'è un obbiettivo da raggiungere, diviso in maniera scalabile attraverso una programmazione serrata con una tabella di allenamento che mescola esercizi di forza e mobilità articolare.
Nel CrossFit quindi c'è un modo oggettivo per codificare e valutare la performance dell'atleta mentre l'allenamento funzionale è più soggettivo ed è basato su esercizi che il corpo compie in interazione con l'ambiente. Il percorso di functional è strutturato per difficoltà progressive con esercizi sempre più complessi e l'obbiettivo di migliorare la capacità di movimento fisiologica, senza puntare ad un distretto muscolare specifico.